Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF346Q9UL40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF346Q9UL40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF346Q9UL40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms