Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA11Q9UKX5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGA11Q9UKX5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms