Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMFRQ9UKV5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMFRQ9UKV5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms