Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC9Q9UKV0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC9Q9UKV0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC9Q9UKV0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms