Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN16Q9UKR8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN16Q9UKR8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN16Q9UKR8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms