Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMP5Q9UJQ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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