Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD1Q9UIS9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms