Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEFF2Q9UIK5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms