Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX20Q9UHI6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX20Q9UHI6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms