Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI5

SLC7A8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A8Q9UHI5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A8Q9UHI5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A8Q9UHI5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A8Q9UHI5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms