Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO40Q9UH90 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO40Q9UH90 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO40Q9UH90 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms