Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3BQ9UH17 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3BQ9UH17 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms