Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTRF1LQ9UGC7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRF1LQ9UGC7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms