Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTI1BQ9UEU0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VTI1BQ9UEU0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms