Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
DKK4Q9UBT3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DKK4Q9UBT3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms