Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3BQ9UBC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms