Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMC3IPQ9P2W1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMC3IPQ9P2W1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMC3IPQ9P2W1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms