Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP36Q9P275 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms