Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNIP1Q9NZI2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP1Q9NZI2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms