Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN3Q9NZ94 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLGN3Q9NZ94 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLGN3Q9NZ94 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms