Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PODXL2Q9NZ53 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXL2Q9NZ53 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms