Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLN6Q9NWW5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN6Q9NWW5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLN6Q9NWW5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms