Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBM28Q9NW13 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBM28Q9NW13 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms