Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCMTD2Q9NV79 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD2Q9NV79 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD2Q9NV79 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms