Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IMP3Q9NV31 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms