Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms