Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GINM1Q9NU53 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms