Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKDREJQ9NTG1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms