Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOMER3Q9NSC5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOMER3Q9NSC5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms