Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms