Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC22A11Q9NSA0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A11Q9NSA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms