Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms