Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMYD2Q9NRG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD2Q9NRG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms