Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS2Q9NRF8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTPS2Q9NRF8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS2Q9NRF8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms