Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPHNQ9NQX3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
GPHNQ9NQX3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPHNQ9NQX3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms