Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCUBE2Q9NQ36 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCUBE2Q9NQ36 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms