Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCRT2Q9NQ03 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCRT2Q9NQ03 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms