Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC4Q9NPG8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms