Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREM1Q9NP99 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms