Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CBX8Q9HC52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX8Q9HC52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX8Q9HC52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms