Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4Q9HBW1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms