Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP29Q9HBJ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms