Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP110Q9HB58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP110Q9HB58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms