Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CLSPNQ9HAW4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CLSPNQ9HAW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms