Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CATSPERBQ9H7T0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CATSPERBQ9H7T0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms