Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4AQ9H788 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4AQ9H788 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2D4AQ9H788 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms