Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5K3

POMK, Protein O-mannose kinase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMKQ9H5K3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMKQ9H5K3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POMKQ9H5K3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMKQ9H5K3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms