Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42EP4Q9H3Q1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP4Q9H3Q1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42EP4Q9H3Q1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42EP4Q9H3Q1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42EP4Q9H3Q1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms