Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARLQ9H300 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PARLQ9H300 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PARLQ9H300 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms