Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG10Q9H0Y0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms